吞噬。日常、現實、世界――絕望也好、希望也罷、善惡之別――無一得以倖免。預言於此蔓延。不久之後，世界將失去一切。而那個曾經拯救過世界的男人，早已迷失了自我。――虛妄與現實的界線消融於現代――20XX年，怪物突然現身，吞噬人們與城市，世界幾乎喪失了所有希望。就在此刻，一位「救世主」降臨。然而，等待他的，卻是以顛覆國家罪為名、荒誕至極的死刑宣判。自我遭到徹底剝奪，被投棄於冰冷的大海之中。然而，在海底的虛無之中，他與「女神」之光合而為一，儘管被恐怖的黑暗觸手所吞噬，他仍奇蹟般地被引渡而歸。失去過去一切的他，以「在原由記」這個新的名字重獲新生，與女主角「佐野甘奈」一同踏上平靜的通學之路。然而，如刀割裂日常般，怪物再度現身，侵蝕著他們的世界。在連自身記憶都逐漸消逝的嚴酷處境中，由記追尋著失蹤的甘奈的身影，被捲入國家陰謀與各方勢力交錯的暗雲漩渦之中。曾經的救世主，如今卻失去了一切力量，兩手空空的他，究竟還能做些什麼――。――