在不久的未來，一顆直徑接近十公里的小行星，以每秒四十公里的速度撞擊地球，人類文明在末日等級的浩劫中一夕湮滅，史稱「星落事件」。那些付得起高額費用的人，還有一部分專業人士和幸運中籤的人們，帶著延續人類文明的希望，在撞擊之前，搭乘太空梭離開地球，並在太空的近地軌道附近，建起一座座的太空城，從此往後的四個多世紀，被人們稱呼為「失根紀元」來銘記這段人類寄居在地球上空歷史。

在一切歸於平靜的四百年後，地球重新恢復綠意，人類也懷抱著希望，準備重返這顆熟悉又陌生的地球。然而這嶄新的世界中，也出現了很多他們意想不到的新物種。